Наполеон о Мюрате: «Не было более решительного, бесстрашного и блестящего кавалерийского начальника». «Он был моей правой рукой, но, предоставленный самому себе, терял всю энергию. В виду неприятеля Мюрат превосходил храбростью всех на свете, в поле он был настоящим рыцарем, в кабинете — хвастуном без ума и решительности».
20 января 1800 года Мюрат породнился с Наполеоном, взяв в жёны его 18-летнюю сестру Каролину. 1804 году исполнял обязанности губернатора Парижа. 19 мая 1804 года стал маршалом Франции.
В 1805 году Австрия в союзе с Россией развязала войну против Наполеона, первые сражения которой австро-русский союз проиграл. В этих сражениях Мюрат показал себя дерзким военоначальником захватив единственноый целого моста через реку Дунай в Вене. Он лично послал австрийскому гереналу, который в это время охранявшего мост, весть о начале перемирия между двумя войсками, а затем ночной внезапной, молниеносной атакой отбил мост у австрийцев, именно поэтому из за перебравшихся по мосту французских войск отступавшая армия Кутузова оказалась в заперти. Но триумф его был не долгим, Мюрат сам попался на хитрость Кутузова, который кверил французского маршала в заключении мира, а сам вывел армию из западни.
В 1806 году Наполеон даровал Мюрату титул герцога германского княжества Клеве и Берг.
В 1806 Мюрат был отправлен на фронт в новом конфликте против Пруссии и России. 8 февраля 1807 года Мюрат в сражении под Прейсиш-Эйлау показал в успешной конной атаке вощедшая в историю как«атака 80 эскадронов .
